ふるさと納税と医療費控除の併用|上限が下がる目安とワンストップ

医療費控除とふるさと納税|医療費控除を使う年は上限が少し下がり、寄附した分も確定申告に書く
こっぺぱん
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出産の年や、子どもの通院が続いた年は、医療費控除が気になります。

同じ年にふるさと納税もすると、上限やワンストップ特例はどうなるのか。

我が家も出産の年などに医療費控除を使い、ふるさと納税は毎年確定申告にしています。

先に結論
  • 医療費控除を使うと、ふるさと納税の上限は少し下がる
  • 目安は、医療費控除10万円あたり約2,400〜2,500円(所得税の税率5〜10%の人)
  • 出産の年は出産育児一時金を差し引くので、控除が小さくなることも多い
  • 確定申告をするとワンストップ特例は無効なので、寄附分も確定申告に書く

先に、医療費控除を入れた上限を確かめると安心です(入れ方は下で説明)。

計算は、さとふるのシミュレーターでできます。

この記事でわかること
  • 医療費控除で、上限がどれくらい下がるか(計算例)
  • 出産の年・子どもの通院が多い年の考え方
  • ワンストップ特例が使えない理由と、確定申告で寄附分を書く手順

我が家の前提

  • 子ども2人(3歳・1歳)・住宅ローンあり・車あり
  • 妻は2人目の出産を機に退職し、今は片働き(それまでは共働き・いずれ戻るかも)
  • 投資歴約8年
  • ふるさと納税は今は私(夫)の名義だけで、手続きは毎年確定申告

医療費控除で上限はどれくらい下がる?|10万円で約2,400〜2,900円(税率しだい)

医療費控除を使う年は、上限が少しだけ下がります。

下がる額は、医療費控除の額の数%ほどです。

医療費控除の額は「医療費−戻ったお金−10万円」

医療費控除の計算式
  • (払った医療費−保険金などで戻ったお金)−10万円
  • 所得(年収から経費などを引いた額)が200万円未満なら、10万円ではなく所得の5%を引く

上限が下がる仕組みと目安

上限は、主に住民税の所得割(所得で決まる部分)の2割で決まります。

  1. 医療費控除で、所得税・住民税がかかる所得が減る
  2. 住民税の所得割が減る(医療費控除の額の10%ほど)
  3. 「所得割の2割」が小さくなり、上限も下がる

医療費控除を使うと損をする、という話ではありません。

医療費控除そのもので、税金は減っています。

所得税の税率は、課税所得で決まります(国税庁 No.2260)。

  • 課税所得195万円未満:5%
  • 195万〜330万円未満:10%
  • 330万〜695万円未満:20%
医療費控除の額所得税の税率5%の人税率10%の人税率20%の人
5万円約1,200円約1,300円約1,400円
10万円約2,400円約2,500円約2,900円
20万円約4,700円約5,000円約5,700円
30万円約7,100円約7,500円約8,600円

※総務省の計算式から出した目安です。

※医療費控除を引いても、税率が変わらない人の数字です。

※ほかの控除の影響は入れていません。

上限を超えた分は、自己負担になります。

上限ぴったりまで寄附する人ほど影響が出やすいので、少し余裕を残します。

シミュレーターは詳細版で医療費控除を入れる

簡易版では医療費控除が入らないことが多いので、詳細版を使います。

  1. 入力欄が「払った医療費」か「控除の額」かを確かめる(医療費の欄は戻った分を引いた額、控除の額の欄はさらに10万円を引いた額)
  2. 12月までにかかりそうな医療費も足して考える
  3. 住宅ローン控除・iDeCoなど、ほかの控除も一緒に入れる

結局、我が家ならどう判断するか

  • 下がるのは数千円ほどなので、医療費控除を使うかは上限の都合で迷わない
  • 寄附は、上限の目安ぴったりを狙わず余裕を残す
  • 端数は、数千円台の返礼品で調整する

出産の年・子どもの通院が多い年はどう考える?

出産の年は、出産育児一時金を差し引く

出産費用は、医療費控除の対象です。

ただし、出産育児一時金は医療費から差し引きます(国税庁 No.1124)。

一時金は、1人の出産につき50万円です。

産科医療補償制度に入っていない医療機関などでの出産は、48.8万円です。

差し引くのは、その出産にかかった費用の範囲までです。

健康保険の高額療養費や、医療保険の入院給付金を受け取ったら、それも差し引きます。

くわしい対象は、国税庁 No.1124で確かめられます。

たとえば、次のような年だったとします。

項目(計算例)金額
出産費用52万円−出産育児一時金50万円2万円
妊婦健診の自己負担分と通院費3万円
家族の通院・薬・歯の治療8万円
医療費の合計13万円
医療費控除(13万円−10万円)3万円

この例だと、上限が下がるのは約700〜900円です(税率5〜20%)。

なお、一時金は法改正で、今後(公布から2年以内)別の給付に変わる予定です。

産休・育休で収入が減る年の上限は、こちらでまとめています。

あわせて読む
育休中・産休中のふるさと納税はできる?上限ゼロの年と損しない判断
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子どもの通院が多い年は、家族の医療費を合計する

医療費控除は、生計が同じ家族の医療費をまとめて計算できます。

  • 子どもの医療費助成がある地域:子どもの分だけでは10万円を超えにくい
  • 申告する人:医療費を実際に払った人がまとめて申告する(収入の多いほうに自由には寄せられない)

上限を出したら、寄附先を選べます。

医療費控除の年はワンストップ特例が使えない|寄附分も確定申告に書く

医療費控除は、確定申告をしないと受けられません。

そのため、その年のワンストップ特例の申請は無効になります。

申請書を出した分も含めて、すべての寄附を確定申告に書きます(国税庁 No.1155)。

気をつけたい失敗:医療費控除だけ申告する

  • ワンストップ特例を出したから大丈夫、と思って医療費控除だけ申告する
  • ワンストップ特例は無効なので、寄附分の控除が受けられない
  • 気づいたら、期限内は訂正申告、期限後は更正の請求で直せる(原則5年以内)

確定申告で寄附分も書く手順

  1. 寄附の受領証明書(またはサイトの証明書)を、その年の分すべて集める
  2. 領収書から医療費控除の明細書を作る(領収書は提出せず、5年間自宅で保管)
  3. 確定申告書に、医療費控除と寄附金控除の両方を入れる
  4. 翌年、住民税決定通知書で寄附金の控除を確かめる

確定申告では、控除は所得税の還付と、翌年の住民税の減額に分かれて戻ります。

我が家は医療費控除を使った年もあり、今は毎年確定申告

始めた1年目は、ワンストップ特例を使いました。

その後、毎年確定申告に切り替えました。

理由は2つです。

  • 医療費控除を使う年は、ワンストップ特例が無効になる
  • 住宅ローン控除の1年目など、確定申告が必要な控除もあった

実際に、出産の年などに医療費控除を使ったこともあります。

その年は、ふるさと納税の寄附額も少し下げました。

今の我が家のやり方

  • 寄附額は、シミュレーターで出した上限の目安の少し手前まで
  • 返礼品は基本がお米の定期便で、端数は数千円台の返礼品で調整
  • 手続きは毎年確定申告で、翌年に住民税決定通知書で確かめる

これまで、上限を超えたことも、超えそうで心配したこともありません。

2026年度の住民税決定通知書でも、控除が合っているのを確かめました。

2026年分は、10月の時点ではまだ申し込んでいません。

昨年までは楽天ふるさと納税で、今年はさとふるを使おうと考えています。

ふるさと納税と医療費控除 よくある質問

Q
医療費控除を使うと、ふるさと納税の上限はどれくらい下がりますか?

医療費控除で住民税の所得割が減るぶん、上限も少し下がります。

税率5〜10%の人なら、10万円あたり約2,400〜2,500円が目安です。

実際の上限は、シミュレーターの詳細版で確かめてください。

Q
ワンストップ特例を申請したあとで、医療費控除の確定申告をしても大丈夫ですか?

確定申告はできますが、その年のワンストップ特例の申請は無効になります。

申請した分も含めて、すべての寄附を確定申告の寄附金控除に書いてください。

Q
出産した年は、医療費控除が使えますか?

出産費用は対象ですが、出産育児一時金(1人50万円)は差し引きます。

差し引くのは、その出産費用の範囲までです。

残った額に家族のほかの医療費を足し、10万円を超えた分が医療費控除です。

所得(年収から経費などを引いた額)が200万円未満なら、所得の5%で考えます。

Q
医療費控除の確定申告で、ふるさと納税を書き忘れたらどうなりますか?

ワンストップ特例は無効なので、そのままでは書き忘れた寄附の分は控除されません。

申告期限(3月15日)までなら、申告書を出し直す「訂正申告」で直せます。

期限後でも原則5年以内なら、「更正の請求」で寄附金控除を追加できます。

分からないときは、税務署に相談してください。

まとめ:医療費控除の年は上限に余裕を残し、寄附分も確定申告に書く

この記事のまとめ
  • 医療費控除は「医療費−戻ったお金−10万円」で、使うと上限は少し下がる
  • 目安は医療費控除10万円あたり約2,400〜2,500円(所得税の税率5〜10%の人)
  • 出産の年は出産育児一時金や保険の給付金を差し引くので、控除が小さくなることも多い
  • 確定申告をするとワンストップ特例は無効で、申請した分も含めて寄附を書く

上限の見込みが出せたら、あとは返礼品を選ぶだけです。

▶ 次に読む1本:ワンストップ特例の期限や、切り替えの注意を確認できます。

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免責事項

本記事は、個人の体験と公開情報をもとにした一般的な情報です(2026年10月時点)。

金額は目安です。

実際の金額は、シミュレーターや市区町村・税務署でご確認ください。

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こっぺぱん
こっぺぱん
30代会社員の2児パパ/投資歴 約8年
30代会社員の2児パパ。共働きのころに「家計はママ任せ」を卒業し、妻が2人目の出産を機に退職した今は、片働きで家計を回しています。固定費削減→節税→投資の順で家計を整える方法を、体験と公的情報の調査ベースで発信中。
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